CentOS命令行安装Matlab R2017b

作者:matrix 发布时间:2019年7月26日星期五 分类:Linux

现在应要求需要再服务器端环境安装matlab以进行更好测试达到理想之效果。

测试环境:本地客户端macOS,服务器centOS 需要20GB空余

下载matlab

https://pan.baidu.com/s/1wijZCXIWsNXgz0yYYBXHnQ#提取e8b2

刚开始用mac三方百度客户端进行下载,没有校验文件md5和基本信息就直接对z01,z02进行解压拿到iso镜像文件挂载没问题。浪费时间一上午进行安装出现输入输出错误原因就是iso不完整。

文件哈希:

$ md5sum R2017b_glnxa64.iso
0bbe62e90ba9aaf357c72ef93e81753c  R2017b_glnxa64.iso

若是本地上传到服务器最好使用rsync附加参数-rP --append来进行断点续传,要不然中断之后重新上传简直。。。

开始安装

需要系统有20GB的剩余空间(包含iso文件,mnt挂载空间,程序安装空间)才可安装,我已经尝试过很多遍了😂😂😂

  1. 挂载镜像文件到/mnt
    $ mount -t iso9660 -o loop R2017b_glnxa64.iso文件路径 /mnt
    

    如果挂载有问题可以考虑直接对iso进行解压缩:

    $ sudo yum install p7zip p7zip-plugins 
    $ 7z x ubuntu-16.10-server-amd64.iso
    
  2. 执行安装

    若之前安装中断或者失败需要清空之前的安装数据,否则会报错。
    删除之前安装的文件:rm -rf /usr/local/MATLAB
    还有安装matlab之前java环境不是必须安装,matlab包里面会自带jre。

    $ cd /mnt
    $ sudo ./install -fileInstallationKey 09806-07443-53955-64350-21751-41297 -agreeToLicense yes -mode silent -activationPropertiesFile  MATLABR2017b_Linux_Crack目录中的license_standalone.lic文件路径
    

    说明:
    license_standalone.lic文件路径需自行替换
    09806-07443-53955-64350-21751-41297为install_key.txt中的授权码

    图片4949-CentOS命令行安装Matlab过程

    执行之后就等待安装,若显示要继续 请点击″是″。 要返回″否″。是否仍要继续?这些也不用管。

    安装完成

    最终等待界面出现End - Successful.Finished即表示安装完成。

破解

安装完成之后执行程序/usr/local/MATLAB/R2017b/bin/matlab显示未激活状态

错误: 激活无法继续。您可能需要执行以下任一操作:
 1.设置 X11 显示,然后重新启动激活过程
 2.使用静默激活功能
 3.使用许可证中心激活

执行激活程序/usr/local/MATLAB/R2017b/bin/activate_matlab.sh -propertiesFile /usr/local/MATLAB/R2017b/activate.ini也没有用。

最后拷贝破解文件解决:
进入破解文件license_standalone.lic,libmwservices.so 所在目录

sudo cp license_standalone.lic /usr/local/MATLAB/R2017b/licenses/ 
sudo cp libmwservices.so /usr/local/MATLAB/R2017b/bin/glnxa64/

启动matlab

设置环境变量,避免每次执行/usr/local/MATLAB/R2017b/bin/matlab很麻烦

$ echo 'export PATH=/usr/local/MATLAB/R2017b/bin:$PATH' >> /etc/profile 
$ source /etc/profile

以后输入matlab就可以启动

Matlab启动成功

卸载之前的iso:umount /mnt

若无法卸载参考https://www.cnblogs.com/sisimi/p/7700309.html来强制推出操作。

后台执行.m脚本

安装服务器版本的最终目的其实就是让其后台运行,但是后面测试的时候发现了很多坑。

比如手动执行nohup matlab -nojvm -nodesktop -nodisplay -nosplash -r test.m > ./logfile &
这样会导致日志输出结果出现大量错误warning的提示,我是直接用supervisord来守护进程,避免手动执行nohup操作。

如果你用nohup matlab -nodesktop -nosplash -nodisplay < test.m >logfile这种<形式来调用脚本那就要小心了,因为会出现更多的错误,像Undefined variable com or class com.mathworks.timer.TimerTask都是小事情,然而我这里是提示语法逻辑错误,感觉是脚本文件加载的时候出现字符问题,原因有很多,我这里没有具体进一步测试。我建议还是不要用<这种形式来执行.m脚本。
参考:https://blog.csdn.net/sethinking/article/details/88375995

还有一个就是执行matlab脚本目录的问题,如果像这样直接-r 'run("/root/test.m");' 执行入口脚本test.m很有可能会找不到其中依赖该目录下的自定义函数。建议-r 'cd /root;test;'这种形式来调用。

最终这样调用:

$ matlab  -nodesktop -nodisplay -nosplash -r 'cd /home/script/;main;'  >> /root/matlab_log_`date +"%Y%m%d"`.log

说明:
/home/script/main.m为脚本入口
这里没有使用-nojvm参数,也没有进一步测试我的脚本依赖是否可以不启动。
>> /root/matlab_log_date +"%Y%m%d".log为输出日志,名称为日期年月日

报错整理

  1. ./install:行269: /bin/glnxa64/install_unix: 输入/输出错误
    确保iso镜像文件的完整性,需要知道iso的文件如果缺失一部分也是可以挂载的。😂
    建议在Windows端用winrar点击R2017b_glnxa64.zip执行解压拿到R2017b_glnxa64.iso

  2. archive is not a ZIP archive那就是空间不足的问题。

  3. 若非首次安装出现问题确保把之前的安装的文件都清空了
    删除之前安装的文件:rm -rf /usr/local/MATLAB

  4. 出现libXt.so。。。Creating local MVM错误

    MATLAB is selecting SOFTWARE OPENGL rendering.
    Unrecognized MATLAB option "version".
    Fatal Internal Error: Unexpected exception: 'N5boost16exception_detail10clone_implINS0_39current_exception_std_exception_wrapperISt13runtime_errorEEEE: Bundle#2 start failed: libXt.so.6: 无法打开共享对象文件: 没有那个文件或目录' in createMVMAndCallParser phase 'Creating local MVM'
    

    这个问题今天上午才搞定,期间安装了很多包都不起作用。MD!!!
    最终执行安装yum install libXt.x86_64才解决。
    中间我也查看过libXt.so.6这个鬼玩意的确是有的,后面看到因为matlab都需要32位和64位的包,所以这鬼玩意一直报错。
    也有可能再期间安装的一部分包是依赖必须的:

    $ yum list  installed |grep libX
    
    libX11.i686                             1.6.5-2.el7                    @base    
    libX11.x86_64                           1.6.5-2.el7                    @base    
    libX11-common.noarch                    1.6.5-2.el7                    @base    
    libX11-devel.x86_64                     1.6.5-2.el7                    @base    
    libXau.i686                             1.0.8-2.1.el7                  @base    
    libXau.x86_64                           1.0.8-2.1.el7                  @base    
    libXau-devel.x86_64                     1.0.8-2.1.el7                  @base    
    libXdamage.x86_64                       1.1.4-4.1.el7                  @base    
    libXdamage-devel.x86_64                 1.1.4-4.1.el7                  @base    
    libXdmcp.i686                           1.1.2-6.el7                    @base    
    libXext.i686                            1.3.3-3.el7                    @base    
    libXext.x86_64                          1.3.3-3.el7                    @base    
    libXext-devel.x86_64                    1.3.3-3.el7                    @base    
    libXfixes.x86_64                        5.0.3-1.el7                    @base    
    libXfixes-devel.x86_64                  5.0.3-1.el7                    @base    
    libXft.x86_64                           2.3.2-2.el7                    @base    
    libXft-devel.x86_64                     2.3.2-2.el7                    @base    
    libXi.i686                              1.7.9-1.el7                    @base    
    libXi.x86_64                            1.7.9-1.el7                    @base    
    libXmu.i686                             1.1.2-2.el7                    @base    
    libXp.i686                              1.0.2-2.1.el7                  @base    
    libXp.x86_64                            1.0.2-2.1.el7                  @base    
    libXrender.x86_64                       0.9.10-1.el7                   @base    
    libXrender-devel.x86_64                 0.9.10-1.el7                   @base    
    libXt.i686                              1.1.5-3.el7                    @base    
    libXt.x86_64                            1.1.5-3.el7                    @base    
    libXtst.i686                            1.2.3-1.el7                    @base    
    libXtst.x86_64                          1.2.3-1.el7                    @base    
    libXxf86vm.x86_64                       1.1.4-1.el7                    @base    
    libXxf86vm-devel.x86_64                 1.1.4-1.el7                    @base 
    

    这里整理一份本机已安装所有libX开头的包,自行取舍。

  5. 大量报错信息 Bad file descriptor 和 Warning: "Error reading character from command line"

参照上面后台执行.m脚本修改命令行调用的方式,去除nohup。使用supervisord工具来守护进程,亦或者不要输出日志。

参考:
https://blog.csdn.net/qq_32892383/article/details/79670871

https://ww2.mathworks.cn/matlabcentral/answers/131366-why-do-i-see-i-o-errors-when-installing-matlab-using-the-iso-image

https://ww2.mathworks.cn/matlabcentral/answers/98745-why-do-i-receive-an-error-message-archive-is-not-a-zip-archive-during-matlab-installation-on-Linux

https://www.jianshu.com/p/a10397fcfb1d

https://blog.csdn.net/Xiao_Song_PKU/article/details/82700228

https://www.cnblogs.com/yaoyaoliu/p/6798463.html

https://Linux.cn/article-7992-1.html

https://blog.csdn.net/qq_39187538/article/details/88676283

https://www.cnblogs.com/sisimi/p/7700309.html

https://www.centos.org/forums/viewtopic.php?t=31436

https://ww2.mathworks.cn/matlabcentral/answers/63751-how-do-i-get-matlab-running-in-batch-mode-to-only-output-the-results-of-disp-fprintf-etc-and-no

https://ww2.mathworks.cn/matlabcentral/answers/66793-problem-running-matlab-script-to-background

matlab调用python库函数和自定义脚本函数

作者:matrix 发布时间:2019年7月15日星期一 分类:零零星星

本来只是想获取字符串的MD5hash值,结果发现麻烦。首先去mathworks找到的DataHash,GetMD5这些函数要么无法使用,要么就是计算出来的md5值是错误的,反正达不到效果。
刚开始以为mathworks的代码必须登录账户才能下载,现在才发现,点击Overview旁边的Functions选项卡就能看到源代码。 😂
图片4928-matlab MD5函数
当初就算是找到了一些函数也是不能使用,最后还是使用python库来解决。好在matlab对python的调用非常简单。直接使用py库就好了,唯一的问题就是有些python的语法和matlab不同,比如切片[:::]操作这些。

安装python3环境

2019-08-19测试发现macos中3.7版本可以,但是在centOS中就调用失败。所以就centOS中测试安装3.5的版本了。
后面发现应该是编译时的enable-shared参数问题。

cd ~
yum install zlib-devel bzip2-devel openssl-devel ncurese-devel
wget https://www.python.org/ftp/python/3.5.0/Python-3.5.0.tgz
tar xf  Python-3.5.0.tgz
cd Python-3.5.0
./configure --enable-shared #matlab要求必须设置enable-shared参数
make &&  make install

参考:
https://ww2.mathworks.cn/help/matlab/matlab_external/undefined-variable-py-or-function-py-command.html#buialof-67
https://ww2.mathworks.cn/help/matlab/getting-started-with-python.html?lang=en

直接调用python内置函数

计算字符串md5函数

使用python的hashlib库进行操作

function[re]=md5(str)
    %{
        依赖python进行md5 hash
    %}
    m2 = py.hashlib.md5();
    m2.update(py.str(str).encode('utf-8'));
    re = char(m2.hexdigest());

说明:
此函数依赖python环境,确保系统中有安装。
兼容Linux,Mac,Windows

最后char函数是将py.str类型转换为matlab的str
知道了这个操作,以后很多操作就会非常简单。
比如

获取当前时间戳:

str2num(char(py.int(py.time.time())))

直接用py库来调用即可,最后再使用matlab函数str2num,char处理成number类型。

调用自定义.py脚本函数

上面的方法倒是可以解决一部分难题,但是遇到方括号[]、百分号%操作符这些直接在.m文件中就不会执行了。毕竟matlab是以它的语法来解析,这样只得起调.py文件来操作。

新建test.py文件位于当前工作目录

def func():
    return '123'[::-1]

载入python脚本:


%脚本所在路径,空字符串表示当前目录 path = '' %当前目录 %path = 'a/' %当前的子目录a if count(py.sys.path,path) == 0 insert(py.sys.path,int32(0),path); end %清除脚本缓存,执行重载操作 clear classes; mod = py.importlib.import_module('test');%载入的脚本模块 %mod = py.importlib.import_module('a.test');%载入的子目录下的脚本模块 py.importlib.reload(mod);

调用py.test.func即可得到切片结果321,注意为py.str类型。
子目录形同:py.子目录.文件名.函数名

当修改py文件之后再调用会发现还是之前的结果,matlab缓存了之前的python脚本,所以这里需要clear classes...这类操作。

参考:
MATLAB 调用 Python

https://www.cnblogs.com/zknublx/p/6212590.html

https://blog.csdn.net/jnulzl/article/details/51170859

https://zhuanlan.zhihu.com/p/42598340

https://blog.csdn.net/x5675602/article/details/52134981

http://www.1cae.com/a/MatLab/52/python-matlab-8943.htm