HHTjim'S 部落格

快速清空超大数据表

作者：matrix 发布时间：2020 年 8 月 31 日 分类：Python 零零星星

第一次drop超过GB的数据表，没想到竟然会执行的这么慢。尝试过TRUNCATE和DROP都不满意。
后来就直接找到数据库储存的文件来删除，这样比起使用sql语句操作会快得多，但也是危险操作，无法找回。

删除操作脚本

运行环境 python3.7,依赖pymysql,根据自身情况配置变量mysql_data_dir,db_config,table_names,condition_save

fast_drop_table.py

#codeing=utf-8
"""
快速清空超大数据表 保留想要数据
"""
import pymysql
import os

mysql_data_dir = '/mnt/mysql_data/db_name/' #数据库文件所在路径

# 数据库连接配置
db_config = {'host': '127.0.0.1', 'port': 3306, 'user': 'user', 'password': 'password', 'db': 'db_name', 'charset': 'utf8'}

# 需要清空操作的数据表
table_names = [
"com_hhtjim_badata_trades_eos_this_quarter",
"com_hhtjim_badata_trades_eth_this_quarter",
  ]

# 数据表保留的查询条件
condition_save = "timestamp  >  '2020-02-20T00:00:00Z'"
# condition_save = False# 不保留


class Db:
    '''
    简单数据库连接操作类
    '''
    def __init__(self,**kwargs):
        self.connection = pymysql.connect(**kwargs)
        self.cursor = self.connection.cursor()


if __name__ == "__main__":
  mysql = Db(**db_config)
  for table_name in table_names:
    os.link('{}{}.frm'.format(mysql_data_dir,table_name), '{}{}.frm.h'.format(mysql_data_dir,table_name))
    os.link('{}{}.ibd'.format(mysql_data_dir,table_name), '{}{}.ibd.h'.format(mysql_data_dir,table_name))


    mysql.cursor.execute('CREATE TABLE {0}_back like {0}'.format(table_name))
    mysql.connection.commit()


    if condition_save:
      mysql.cursor.execute("INSERT INTO {0}_back SELECT * FROM {0}  WHERE {1} ;".format(table_name,condition_save))
      mysql.connection.commit()


    mysql.cursor.execute("drop table {}".format(table_name))
    mysql.connection.commit()

    mysql.cursor.execute("alter table  {0}_back rename to  {0};".format(table_name))
    mysql.connection.commit()


    os.unlink('{}{}.frm.h'.format(mysql_data_dir,table_name))
    os.unlink('{}{}.ibd.h'.format(mysql_data_dir,table_name))

    print('succeed: {}'.format(table_name))

具体步骤

### 找到frm，ibd文件

根据数据库存储路径找到需要删除的表名的frm，ibd文件。

### 建立硬连接
$ ln mytable.ibd  mytable.ibd.h
$ ln mytable.frm  mytable.frm.h


### 备份表结构
CREATE TABLE mytable_back like mytable;

### 备份想要保留的数据
INSERT INTO mytable_back SELECT * FROM mytable  WHERE timestamp  >  '2020-02-27T00:00:00Z' ;

### 删除旧表
drop table mytable;

### 修改备份表名字
alter table  mytable_back rename to  mytable;


### 删除硬连接
$ rm -f  mytable.frm.h  mytable.ibd.h

参考：
https://blog.csdn.net/weixin_34034261/article/details/86250223

matlab调用python库函数和自定义脚本函数

作者：matrix 发布时间：2019 年 7 月 15 日 分类：零零星星

本来只是想获取字符串的MD5hash值，结果发现麻烦。首先去mathworks找到的DataHash，GetMD5这些函数要么无法使用，要么就是计算出来的md5值是错误的，反正达不到效果。
刚开始以为mathworks的代码必须登录账户才能下载，现在才发现，点击Overview旁边的Functions选项卡就能看到源代码。 😂

当初就算是找到了一些函数也是不能使用，最后还是使用python库来解决。好在matlab对python的调用非常简单。直接使用py库就好了，唯一的问题就是有些python的语法和matlab不同，比如切片[:::]操作这些。

安装python3环境

2019-08-19测试发现macos中3.7版本可以，但是在centOS中就调用失败。所以就centOS中测试安装3.5的版本了。
后面发现应该是编译时的enable-shared参数问题。

2020-02-18centos中测试可以直接用conda来安装python3.5使用，3.6，3.7测试调用失败！

开始手动编译安装

cd ~
yum install zlib-devel bzip2-devel openssl-devel ncurese-devel
wget https://www.python.org/ftp/python/3.5.0/Python-3.5.0.tgz
tar xf  Python-3.5.0.tgz
cd Python-3.5.0
./configure --enable-shared #matlab要求必须设置enable-shared参数
make &&  make install

参考：
https://ww2.mathworks.cn/help/matlab/matlab_external/undefined-variable-py-or-function-py-command.html#buialof-67
https://ww2.mathworks.cn/help/matlab/getting-started-with-python.html?lang=en

切换默认的python解释器

matlab输入pyversion`可以查看python解释器路径，如果需要修改：

 pyversion /usr/local/bin/python3 %切换到python3.7指定路径

直接调用python内置函数

计算字符串md5函数

使用python的hashlib库进行操作

function[re]=md5(str)
    %{
        依赖python进行md5 hash
    %}
    m2 = py.hashlib.md5();
    m2.update(py.str(str).encode('utf-8'));
    re = char(m2.hexdigest());

说明：
此函数依赖python环境，确保系统中有安装。
兼容Linux，Mac，Windows

最后char函数是将py.str类型转换为matlab的str
知道了这个操作，以后很多操作就会非常简单。
比如

获取当前时间戳：

str2num(char(py.int(py.time.time())))

直接用py库来调用即可，最后再使用matlab函数str2num，char处理成number类型。

调用自定义.py脚本函数

上面的方法倒是可以解决一部分难题，但是遇到方括号[]、百分号%操作符这些直接在.m文件中就不会执行了。毕竟matlab是以它的语法来解析，这样只得起调.py文件来操作。

新建test.py文件位于当前工作目录

def func():
    return '123'[::-1]

载入python脚本：

%脚本所在路径，空字符串表示当前目录
path = '' %当前目录
%path = 'a/' %当前的子目录a
if count(py.sys.path,path) == 0
    insert(py.sys.path,int32(0),path);
end

%清除脚本缓存，执行重载操作
clear classes;
mod = py.importlib.import_module('test');%载入的脚本模块  
%mod = py.importlib.import_module('a.test');%载入的子目录下的脚本模块 
py.importlib.reload(mod);

调用py.test.func即可得到切片结果321,注意为py.str类型。
子目录形同：py.子目录.文件名.函数名

当修改py文件之后再调用会发现还是之前的结果，matlab缓存了之前的python脚本，所以这里需要clear classes...这类操作。

参考：
MATLAB 调用 Python

https://www.cnblogs.com/zknublx/p/6212590.html

https://blog.csdn.net/jnulzl/article/details/51170859

https://zhuanlan.zhihu.com/p/42598340

https://blog.csdn.net/x5675602/article/details/52134981

http://www.1cae.com/a/MatLab/52/python-matlab-8943.htm

无法安装python3的连续报错-mysql include软链接问题

作者：matrix 发布时间：2019 年 3 月 12 日 分类：Python

虚拟机ubuntu中自带了Python2，但是想要使用python3需要单独安装。使用add-apt-repository来添加ppa源安装提示command not found,之后进行安装操作sudo apt-get install software-properties-common，错误继续：

$ sudo apt-get install software-properties-common
Reading package lists... Done
Building dependency tree... 50%
Building dependency tree       
Reading state information... Done
You might want to run 'apt-get -f install' to correct these:
The following packages have unmet dependencies:
 libmysql++-dev : Depends: libmysqlclient-dev but it is not going to be installed
 software-properties-common : Depends: python3:any (>= 3.3.2-2~)
                              Depends: python3 but it is not going to be installed
                              Depends: python3-gi but it is not going to be installed
                              Depends: gir1.2-glib-2.0 but it is not going to be installed
                              Depends: python-apt-common (>= 0.9) but it is not going to be installed
                              Depends: python3-dbus but it is not going to be installed
                              Depends: python3-software-properties (= 0.96.20.8) but it is not going to be installed
E: Unmet dependencies. Try 'apt-get -f install' with no packages (or specify a solution).

继续apt-get update & upgrade & 更换国内源，后面使用apt-get install python3也是相同错误，无济于事。
错误跟踪到libmysql++-dev依赖问题，遂重新安装sudo apt-get install libmysqlclient-dev:

$ sudo apt-get install libmysqlclient-dev
Reading package lists... Done
Building dependency tree       
Reading state information... Done
The following NEW packages will be installed:
  libmysqlclient-dev
0 upgraded, 1 newly installed, 0 to remove and 163 not upgraded.
4 not fully installed or removed.
Need to get 0 B/1,167 kB of archives.
After this operation, 7,040 kB of additional disk space will be used.
debconf: delaying package configuration, since apt-utils is not installed
(Reading database ... 51891 files and directories currently installed.)
Preparing to unpack .../libmysqlclient-dev_5.7.25-0ubuntu0.16.04.2_amd64.deb ...
Unpacking libmysqlclient-dev (5.7.25-0ubuntu0.16.04.2) ...
dpkg: error processing archive /var/cache/apt/archives/libmysqlclient-dev_5.7.25-0ubuntu0.16.04.2_amd64.deb (--unpack):
 unable to install new version of '/usr/include/mysql/mysql/plugin_ftparser.h': No such file or directory
Errors were encountered while processing:
 /var/cache/apt/archives/libmysqlclient-dev_5.7.25-0ubuntu0.16.04.2_amd64.deb
E: Sub-process /usr/bin/dpkg returned an error code (1)

尝试手动安装deb：sudo dpkg -i /var/cache/apt/archives/libmysqlclient-dev_5.7.25-0ubuntu0.16.04.2_amd64.deb失败：

unable to install new version of '/usr/include/mysql/mysql/plugin_ftparser.h': No such file or directory

根源问题

/usr/include/mysql/mysql/plugin_ftparser.h不存在
开始手动查找

$ sudo find / | grep plugin_ftparser.h

该文件只存在与/usr/local/mysql/include/目录中，ls /usr/include/mysql -al查看列表就会发现mysql的软链接出现问题导致的。

解决

重新生成mysql include软连接

$ ln -s /usr/local/mysql/include /usr/include/mysql/mysql #重新生成软连接

此虚拟机中的mysql是之前安装LNMP搭建PHP环境而创建的，很有可能和这个有关系。

参考：
https://askubuntu.com/questions/629448/file-mysql-h-cant-be-found
https://askubuntu.com/questions/773079/fixing-broken-packages-in-ubuntu-repost

PEACE～